Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDNFQ49AH0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CDNFQ49AH0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms