Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NBPF1Q3BBV0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms