Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TWISTNBQ3B726 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TWISTNBQ3B726 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms