Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ODF4Q2M2E3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms