Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSPP1Q1MSJ5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSPP1Q1MSJ5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms