Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC142Q17RM4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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