Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNAPC1Q16533 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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