Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA3Q16281 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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