Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SEMA3AQ14563 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SEMA3AQ14563 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SEMA3AQ14563 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SEMA3AQ14563 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SEMA3AQ14563 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SEMA3AQ14563 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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