Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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SPIDRQ14159 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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SPIDRQ14159 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIDRQ14159 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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