Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM29Q14134 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM29Q14134 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms