Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SGCGQ13326 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SGCGQ13326 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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