Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BNIP3Q12983 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms