Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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GRIN2AQ12879 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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GRIN2AQ12879 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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GRIN2AQ12879 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GRIN2AQ12879 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
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GRIN2AQ12879 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
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GRIN2AQ12879 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
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GRIN2AQ12879 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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GRIN2AQ12879 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GRIN2AQ12879 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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