Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CYP4F3Q08477 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CYP4F3Q08477 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms