Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA3Q08378 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms