Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCN1BQ07699 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms