Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LTBQ06643 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LTBQ06643 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LTBQ06643 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms