Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEUP1Q05D60 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms