Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EMX2Q04743 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EMX2Q04743 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms