Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTUD4Q01804 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms