Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
DEFA6Q01524 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms