Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDK6Q00534 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms