Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PKD1P98161 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKD1P98161 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKD1P98161 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKD1P98161 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKD1P98161 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKD1P98161 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKD1P98161 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKD1P98161 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKD1P98161 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKD1P98161 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKD1P98161 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PKD1P98161 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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