Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAD23AP54725 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms