Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP12AP54707 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP12AP54707 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms