Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSR4P51571 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSR4P51571 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSR4P51571 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSR4P51571 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSR4P51571 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSR4P51571 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSR4P51571 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSR4P51571 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSR4P51571 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSR4P51571 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSR4P51571 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSR4P51571 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSR4P51571 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR4P51571 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR4P51571 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR4P51571 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR4P51571 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR4P51571 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSR4P51571 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSR4P51571 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms