Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSEN1P49768 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSEN1P49768 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms