Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NESP48681 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NESP48681 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NESP48681 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NESP48681 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NESP48681 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NESP48681 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NESP48681 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NESP48681 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NESP48681 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NESP48681 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NESP48681 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NESP48681 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NESP48681 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NESP48681 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NESP48681 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NESP48681 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms