Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PIP4K2AP48426 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PIP4K2AP48426 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms