Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IQGAP1P46940 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQGAP1P46940 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms