Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACADSBP45954 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms