Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CASP2P42575 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CASP2P42575 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CASP2P42575 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CASP2P42575 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms