Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3CBP42338 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms