Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GRIA2P42262 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms