Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARGP37231 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPARGP37231 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms