Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTN2P35609 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTN2P35609 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms