Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms