Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPC1P35052 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPC1P35052 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms