Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABCC1P33527 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABCC1P33527 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms