Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OTX2P32243 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
OTX2P32243 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
OTX2P32243 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms