Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPOP30536 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPOP30536 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPOP30536 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPOP30536 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPOP30536 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TSPOP30536 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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