Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2E2P29084 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms