Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRB3P28472 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRB3P28472 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms