Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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