Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERBB3P21860 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms