Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RHCEP18577 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RHCEP18577 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHCEP18577 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms