Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
XBP1P17861 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
XBP1P17861 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XBP1P17861 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XBP1P17861 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms