Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms