Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLBP1P12271 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RLBP1P12271 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms